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定向蛋白质降解的解决方案

定向蛋白质降解 (TPD) 是一种利用细胞自身销毁机制分解导致或驱动疾病进展的蛋白质的治疗方法。这些靶标蛋白中许多缺乏某些特征，如针对效应蛋白相互作用的限定口袋，并且使用传统方法时“不可成药靶”。蛋白质降解者平台（如蛋白酶解导引嵌合体 (PROTAC) 和分子胶降解者）利用泛素-蛋白酶体通路启动降解，而诸如自噬体束缚化合物 (ATTEC)、自噬导引嵌合体 (AUTOTAC) 和自噬导引嵌合体 (AUTAC) 等平台、基于抗体的 PROTAC (AbTAC) 和溶酶体导引嵌合体 (LYTAC) 等平台利用自噬体或溶酶体系统。这些平台连同其他 TPD 模式一起可以通过在目的蛋白和效应分子之间创造桥梁，导引以前不可成药的蛋白质发生降解，从而为广泛类型疾病的潜在靶向药物治疗提供新策略。

Cell Signaling Technology 的科学家拥有深厚的信号技术专业知识，可以帮助您了解 TPD 治疗的靶向和脱靶效应。您还可以接触包含各种产品的广泛目录以及行业领先的蛋白质组学服务，从而可以帮助您简化 TPD 发现工作流程中的不同步骤，使您能够更好验证潜在的 TPD 分子。

定向蛋白质降解 (TPD) 产品和服务

概述

TPD 药物发现工作流程。 （步骤 1）设计可与 E3 连接酶和靶标蛋白结合的降解者。（步骤 2）确认降解者与 E3 连接酶和靶标蛋白形成三元复合体。（步骤 3）检查靶标蛋白聚泛素化。（步骤 4）对靶标降解定量。（步骤 5）研究中靶和脱靶效应，以了解降解靶标蛋白的表型后果。

降解者发现

降解者发现

使用以下产品确定目的细胞或组织中驱动疾病进展的靶标蛋白和相关的 E3 泛素连接酶。

  • 靶标蛋白抗体：针对潜在靶标的特异性、经应用验证的抗体，包括：
  • 已针对您的平台验证 E3 连接酶抗体识别诸如 CRBN、VHL、KEAP1 和 MDM2 等 E3 连接酶的特异性抗体。欲知一系列 E3 泛素连接酶及其已知底物，请参阅泛素连接酶表。
  • 蛋白质组学分析服务借助于 CST 蛋白质组学分析服务，剖析关键蛋白质和翻译后修饰，以快速确定潜在靶标和 E3 泛素连接酶。这些服务提供化学性蛋白质组学，以确定复杂蛋白质组中的反应性半胱氨酸，开发共价性抑制剂药物，从而让您揭示新型半胱氨酸，这些半胱氨酸调节蛋白质功能或帮助识别易受亲电弹头影响的细胞靶标。
  • 半胱氨酸剖析：在复杂生物系统的背景下定位目的蛋白上的反应性氨基酸侧链。使用反应性半胱氨酸标记法连同肽富集质谱分析获得优化的工作流程解决方案，以高效确定并且量化重要蛋白质靶标上可接近的反应性半胱氨酸位点。

三元复合体形成

三元复合体形成

使用 TR-FRET、免疫共沉淀和 AlphaLISA 研究三元复合体形成，以确定 TPD 分子的结合效率并查明 E3 连接酶与靶蛋白之间的接近度是否最适合泛素转移。

CST 提供经过验证且可重复的现成解决方案，包括加标签抗体和匹配抗体对，以支持三元复合体形成实验。没有看到您的平台所需的偶联过程或制剂？CST 可以为您开发、优化和验证它。

  • 定制化偶联服务：CST 拥有高度经验的定制偶联专家，您可以信赖他们。如果您在我们的目录中没有看到您的平台所需的偶联抗体，我们可以为您将抗体与金属、荧光团、生物素或 DIG 偶联。查看贵方分析平台兼容性抗体的资源和指南，找到将适用贵方平台的偶联过程。
  • 匹配抗体对：无载体蛋白、随时偶联型匹配抗体已为您作了优化，随时用于您的 TR-FRET 测定法。
  • 用于免疫学测定法开发的定制制剂：订购无 BSA、无叠氮化物和无甘油的抗体制剂，用于开发您的 ELISA 样测定法和体内功能测定法。
  • 抗标签抗体：使用特异、灵敏的 CST® 加标签抗体在免疫共沉淀实验中下拉转染的重组加标签蛋白质。
  • 蛋白质组学分析服务： 定性和定量剖析您样品中的蛋白质。CST 科学家可以实施串联质量标签 (TMT) 测定法评估蛋白质-蛋白质相互作用，并实施邻近标记法 (TurboID/BioID) 为您确认三元复合体形成。

靶标泛素化

靶标泛素化

使用 CST 蛋白质稳态抗体确认靶标蛋白的泛素化，或使用 PTMScan® 泛素试剂盒或利用 CST 蛋白质组分析服务获得靶标蛋白上所有泛素化位点的全面视图。

靶标降解

靶标降解

通过使用 CST 目录中提供的广泛类型特异且灵敏抗体之任一者，定性定量地监测 TPD 治疗实验后靶标蛋白的水平。

经过应用验证的转录因子、受体酪氨酸激酶、丝氨酸/苏氨酸激酶、核受体、淋巴细胞信号转导、Jak/Stat 蛋白、Bcl-2 家族蛋白、帕金森病相关蛋白等抗体随时准备帮助您进行靶标降解实验。

您可以找到针对您的目的靶标的高质量抗体，这些抗体已经过验证并批准用于以下某些应用：

此外，现成或定制的无载体蛋白抗体可用于高通量 ELISA 样平台。您的平台需要专用偶联过程吗？也可提供定制偶联服务。

如果您的靶标是某蛋白质如 EGFR 的突变形式，请搜索 CST 的突变体特异性抗体目录。没有看到您正在寻找的蛋白质突变？请联系我们，了解如何为您开发、优化和验证它。

中靶/脱靶效应

中靶/脱靶效应

利用 CST 蛋白质组学分析服务，在分子层面广泛理解 TPD 分子脱靶效应。

与 CST 科学家合作，执行以下操作：

  • 蛋白质组学发现服务：
    • PTMScan发现蛋白质组学服务根据您的目的靶标，对样品中的泛素化、磷酸化、乙酰化和甲基化蛋白质进行全面 PTM 分析，以监测 TPD 分子的下游影响。
    • KinomeView® 服务在靶向激酶时确定在 TPD 分子治疗中受调节的激酶组区域。
  • 总蛋白质组分析：
    • 通过时程研究深入了解 TPD 分子的下游效应并确定效力。
    • 了解 TPD 分子的中靶特异性和脱靶交叉反应性。
  • UbiScan – 泛素化蛋白质组学使用 LC-MS/MS 定量分析数千个非冗余泛素化序列，以确定被不利靶向受到蛋白酶体降解的脱靶蛋白质。

或使用以下 CST 试剂盒之一：

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