免疫沉淀法实验步骤(针对天然蛋白质)
本实验步骤适用于天然蛋白质免疫沉淀法,随后通过蛋白质免疫印迹或激酶活性检测进行分析。使用 Protein A Magnetic Beads #70024 时,请参阅利用磁性分离的免疫沉淀实验步骤。
A. 溶液与试剂
注:利用反渗透去离子水 (RODI) 或同等级别的水配制溶液。
- 20 X Phosphate Buffered Saline (PBS) #9808:要制备 1 L 1X PBS:添加 50 mL 20X PBS 至 950 mL dH2O 中,混合。
- 10X Cell Lysis Buffer #9803:要制备 10 mL 1X 细胞裂解缓冲液,添加 1 mL 10X 细胞裂解缓冲液至 9 mL dH2O 中,混合。
注:使用前,立即加入 1 mM PMSF #8553。
- 3X SDS 样品缓冲液:使用 Blue Loading Buffer Pack #7723。通过添加 1/10 体积的 30X DTT 到 1 体积的 3X SDS 上样缓冲液中,制备新鲜的 3X 还原上样缓冲液。
- Protein A 或 G 琼脂糖微珠(针对非偶联的一抗):将 Protein A #37478 用于小鼠 IgG 免疫沉淀法。
- 固定化 Streptavidin (Sepharose Bead Conjugate) #3419:轻轻地涡旋搅拌小瓶,并在每次免疫沉淀中使用 10 µL。
- 10X Kinase Buffer(用于激酶测定)#9802:要制备 1 mL 的 1X 激酶缓冲液,将 100 µL 10X 激酶缓冲液加入到 900 µL dH2O 中,混合。
- ATP (10 mM)(用于激酶测定)#9804:要制备 0.5 mL ATP (200 µM),将 10 µL ATP (10 mM) 加入到 490 µL 1X 激酶缓冲液中。
B. 制备细胞裂解物
- 吸干培养基。添加含有调节分子的新鲜培养基,对细胞进行一段时间的处理。
- 在非变性条件下收集细胞,去除培养基后用冰预冷的 1X PBS 洗涤细胞一次。
- 去除 PBS 并给每个培养板 (10 cm) 添加 0.5 mL 冰冷的 1X 细胞裂解缓冲液,并将其放在冰上孵育 5 分钟。
- 从板上刮下细胞,并且将提取物转移至微量离心管。置于冰上。
- 在冰上对样品进行 3 次超声处理,每次 5 秒。
- 使用微量离心机在 4°C 下以 14,000 x g 的离心力离心 10 分钟,然后将上清液转移到一个新管中。上清液即为细胞裂解物。如有必要,裂解物可保存在 –80°C。
C. 免疫沉淀法
细胞裂解物预澄清(针对非偶联和生物素化抗体的可选步骤)
强烈建议进行细胞裂解物预澄清步骤,以减少与 Protein A、Protein G 或 Streptavidin 微珠的非特异性蛋白结合。为检测样品和同型对照预澄清足够裂解物。
- 向 1 mg/mL 的 200 μL 细胞裂解液中加入 20 μL Protein A
- 在 4°C 下,旋转孵育 30-60 分钟。
- 使用微量离心机在 4°C 下离心 10 分钟,然后将上清液转移到一个新管中。
- 根据所用的一抗,继续后续对应的实验步骤。
免疫沉淀法:
重要事项:强烈建议使用相应的同型对照,以便在你的一抗免疫沉淀中显示特异性结合。同型对照的浓度应匹配,并与一抗样品同时进行实验。
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一抗 |
推荐的 IgG 对照 |
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兔多克隆抗体 |
Normal Rabbit IgG #2729 |
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Rabbit monoclonal antibody |
Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900 |
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小鼠单克隆 IgG1 抗体 |
Mouse (G3A1) mAb IgG1 Isotype Control #5415 |
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小鼠单克隆 IgG2a 抗体 |
Mouse (E5Y6Q) mAb IgG2a Isotype Control #61656 |
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小鼠单克隆 IgG2b 抗体 |
Mouse (E7Q5L) mAb IgG2b Isotype Control #53484 |
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小鼠单克隆 IgG3 抗体 |
Mouse (E1D5H) mAb IgG3 Isotype Control #37988 |
使用非偶联的一抗
- 将一抗(按产品网页或产品说明书中推荐的合适稀释比例制备)加入到浓度为 1 mg/mL 的 200 µL 细胞裂解液中。轻柔震荡下 4°C 过夜孵育。
- 添加 Protein A #37478 琼脂糖(20 μL 50% 珠子混悬液)。轻轻摇动,在 4°C 下孵育 1-3 小时。
- 用微量离心机在 4°C 下离心 30 秒。用 500 µL 的 1X 细胞裂解缓冲液洗涤沉淀物 5 次。洗涤间期,保持样品于冰上。
- 继续使用蛋白免疫印迹法或激酶活动进行分析(D 部分)。
使用生物素化一抗
- 将生物素化抗体(按产品网页或产品说明书中推荐的合适稀释比例制备)加入到浓度为 1 mg/mL 的 200 µL 细胞裂解液中。轻柔震荡下 4°C 过夜孵育。
- 轻轻混合固定化 Streptavidin (Sepharose Bead Conjugate) #3419,并添加 10 µL 珠子混悬液。轻轻摇动,在 4°C 下孵育 2 小时。
- 用微量离心机在 4°C 下离心 30 秒。用 500 µL 的 1X 细胞裂解缓冲液洗涤沉淀物 5 次。洗涤间期,保持样品于冰上。
- 继续使用蛋白免疫印迹法或激酶活动进行分析(D 部分)。
使用固定化的抗体 (Sepharose Bead Conjugate)
- 轻轻混合,并加入固定了抗体的磁珠 (10 µL) 到浓度为 1 mg/mL 的 200 µL 细胞裂解液中。轻柔震荡下 4°C 过夜孵育。
- 用微量离心机在 4°C 下离心 30 秒。用 500 µL 的 1X 细胞裂解缓冲液洗涤沉淀物 5 次。洗涤间期,保持样品于冰上。
- 继续使用蛋白免疫印迹法或激酶活动进行分析(D 部分)。
使用固定化的抗体 (磁珠偶联)
- 轻轻混合,并加入固定化的珠子接合物 (10 µL) 到浓度为 1 mg/mL 的 200 µL 细胞裂解液中。轻柔震荡下 4°C 过夜孵育。
- 将试管放在 Magnetic Separation Rack #14654 上,使磁珠沉淀。用 500 µL 的 1X 细胞裂解缓冲液洗涤 5 次。
- 继续使用蛋白免疫印迹法或激酶活动进行分析(D 部分)。
D. 样品分析
根据分析类型,继续后续对应的实验步骤。
注:对于磁珠,请勿离心;而应使用 Magnetic Separation Rack #14654。
用蛋白免疫印迹法进行分析
- 用 20-40 µL 3X SDS 样品缓冲液重悬沉淀物。涡旋振荡,然后再用微量离心机离心 30 秒。
- 将样品加热至 95-100°C 并持续 2-5 分钟,然后用微量离心机以 14,000 x g 的离心力离心 1 分钟。
- 将样品 (15-30 µL) 上样到 SDS-PAGE 凝胶上。
- 采用蛋白质免疫印迹法分析样品。请参阅蛋白免疫印迹法实验步骤。
注:为尽量减少变性重链对目标条带的掩蔽或由变性轻链产生的干扰,建议采用以下二抗:
对于分子量约为 50 kDa 的蛋白质:
Mouse Anti-rabbit IgG (Light-Chain Specific) (D4W3E) mAb #45262
Mouse Anti-Rabbit IgG (Light-Chain Specific) (D4W3E) mAb (HRP Conjugate) #93702
Mouse Anti-rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb #3678
Mouse Anti-rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb (HRP Conjugate) #5127
对于分子量约为 25 kDa 的蛋白质:
Mouse Anti-rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb #3678
Mouse Anti-rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb (HRP Conjugate) #5127
用激酶活性测定法进行分析
- 用 500 µL 1X 激酶缓冲液洗涤沉淀物两次。置于冰上。
- 用补充有 200 µM ATP 和合适底物的 40 µL 1X 激酶缓冲液重悬沉淀。
- 30°C 下孵育 30 分钟。
- 用 20 µL 3X SDS 样品缓冲液终止反应。涡旋振荡,然后再用微量离心机离心 30 秒。
- 将含有磷酸化底物的上清转移到另一管中。
- 将样品加热至 95-100°C 并持续 2-5 分钟,然后用微量离心机以 14,000 x g 的离心力离心 1 分钟。
- 将样品 (15-30 µL) 上样到 SDS-PAGE 凝胶上。