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对细胞系进行 TMT10plex™ 蛋白质组分析

使用 TMT10plex™ 对全球实验室中常用的 14 种人细胞系进行分析。在多个 10 重实验中,所有 14 种细胞系(编号参见下文)的肽混合物被用于定量标准化。对每种细胞系中与对照混合物相对的相对蛋白富集度进行计算和颜色编码,以反映富集度高于对照物(绿色)或低于对照物(红色)的蛋白。

幻灯片 1 热图

14 种人细胞系(编号)中使用 TMT10plex™ 测得的颜色编码的相对蛋白富集度热图。对超过 8000 种蛋白进行定量(上图),部分数据点显示为颜色编码,与对照混合物相对的富集度变化用 % 表示(下图)。

客户可以使用分级群聚或其他工具整体查看数据,也可以在表中查看个别蛋白数据。

将 TMT10plex™ 数据与蛋白质印迹法 (WB) 进行对比,以验证蛋白富集度测量值。TMT™ 定量与蛋白质印迹法的一致性良好。FoxA2 和 CD3ε 表达水平根据细胞系有所不同,而 Erk1 和 Erk2 显示在表达方面的变化不那么依赖于细胞系。

TMT 蛋白质印迹法

使用 TMT10plex™ 表达谱(柱状图)和调整的蛋白质印迹法对 14 种人细胞系(编号)进行相对蛋白富集度定量 - FoxA2(上图)、CD3ε(中间)和 Erk1/2(下图)。

这些数据表明,TMT10plex™ Total Proteome 方法能够提供有关复用样本相对蛋白富集度的详细、定量信息。

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