内源性和外源性细胞凋亡通路会涉及 Caspase 的级联放大反应。人类蛋白质组中包含数千个已知或假定的 Caspase 剪切位点。大多数 Caspase 底物是在天冬氨酸残基上进行剪切的，这会生成带 DEXD 基序的含天冬氨酸羧基端的众多片段，其中会一些不同。
针对 Caspase 剪切蛋白质组学的 PTMScan® 技术使用靶向 DEXD 基序的专有抗体，可在进行 LC-MS/MS 之前对胰蛋白酶消化样品中已剪切的 Caspase 底物肽进行富集。
Caspase 剪切底物蛋白质组学：该基序标识是在 PTMScan® LC-MS/MS 实验中生成的，期间使用来自 Hela 细胞（经 Staurosporine #9953 处理以诱导细胞凋亡 [1 μM，3 小时]）的含天冬氨酸羧基端的 1044 条非冗余性胰蛋白酶肽。这些肽使用了 PTMScan® Cleaved Caspase Substrate Motif [DE(T/S/A)D] Kit #12810 进行富集。该标识表示各位置上氨基酸引导至天冬氨酸羧基端的相对频率。
![Cleaved Caspase Substrate Motif [DE(T/S/A)D] MultiMab 蛋白质印迹法](http://media.cellsignal.cn/www/images/proteomics/ptmscan-discovery-workflow-caspase-wb.jpg)
Cleaved Caspase Substrate Motif [DE(T/S/A)D] MultiMab® Rabbit mAb mix #8698：未经 (-) 或经 Staurosporine #9953 处理（1 μM，3 小时；+）的 NIH/3T3 与 Hela 细胞的蛋白质印迹法分析将 Cleaved Caspase Substrate Motif [DE(T/S/A)D] MultiMab® Rabbit mAb mix（上图）或 GAPHD (D16H11) XP® Rabbit mAb #5174 作为上样对照（下图）。
| 靶标描述 | 基序 | 参考数据 |
|---|---|---|
| 靶标描述 | 基序 | 参考数据 |
| 已剪切的 Caspase 底物 | DEXD |