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13936
Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody
一抗
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Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody #13936

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使用 Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody 对小鼠脑组织和大鼠眼部组织的提取物进行蛋白质印迹分析。使用磷酸肽或非磷酸肽的靶标残基 Ser42 进行抗体封闭，以验证 Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody 的磷酸特异性。

Western Blotting Image 2: Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody

使用 Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody (上图) 和 α-Actinin (D6F6) XP®Rabbit mAb #6487(下图)，对未经处理 (-) 或已经 λ 磷酸酶处理 (+) 的小鼠脑组织提取物进行蛋白质印迹分析。

Western Blotting Image 3: Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody

使用 Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody (上图) 和 DYKDDDDK Tag (9A3) Mouse mAb #8146 (下图)，对转染空载 (-) 或转染带有 DDK 标签的全长野生型小鼠 BMAL1 蛋白 (wt mBMAL1-DDK，+) 或 DDK 标签的全长野生型小鼠 BMAL1 Ser42A 位点特异突变体 (S42A mBMAL1-DDK; +) 表达载体的 293T 细胞提取物进行蛋白质印迹分析。野生型和 S42A 位点特异突变体的 BMAL1 建构体由 Boston Children's Hospital 的 Jonathan Lipton 博士友情提供。

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支持数据

反应性 H M R
敏感性 内源性
MW (kDa) 78
来源 兔

应用缩写：

  • W-Western
  • IP-免疫沉淀法
  • IHC-免疫组织化学法
  • ChIP-染色质免疫沉淀法
  • IF-免疫荧光法
  • F-流式细胞术
  • E-P-ELISA 肽

物种交叉反应性缩写：

  • H-人
  • M-小鼠
  • R-大鼠
  • Hm- 仓鼠
  • Mk-猴子
  • Vir- Virus
  • Mi-水貂
  • C-鸡
  • Dm-黑腹果蝇
  • X-爪蟾
  • Z-斑马鱼
  • B-牛
  • DG-狗
  • PG-猪
  • Sc-酿酒酵母
  • Ce-秀丽隐杆线虫
  • Hr-马
  • All-预期所有物种

产品使用信息

应用 稀释度
蛋白质印迹法 1:1000
免疫沉淀 1:50

保存

保存在 10mM sodium HEPES（pH 为 7.5）、150 mM NaCl、100 µg/ml BSA 和 50% 甘油中。存储温度为 -20℃。请不要分装抗体。

实验步骤

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蛋白质印迹法实验步骤

蛋白质印迹法就是将膜与 5% w/v 脱脂奶粉、1X TBS 以及 0.1% Tween® 20 中的稀释的一抗在 4°C 下进行夜间孵育，同时轻轻晃动。

注意：请参阅一抗产品网页了解建议使用的抗体稀释度。

A. 溶液和试剂

注意：使用反渗透去离子水 (RODI) 或同等级别的水制备溶液。

  1. 20X 磷酸盐缓冲液 (PBS)：(#9808) 要制备 1 L 1X PBS：加入 50 ml 20X PBS 至 950 ml dH2O 并混合。
  2. 10 X Tris 盐缓冲液 (TBS)：(#12498) 要制备 1 L 1X TBS：加入 100 ml 10X 至 900 ml dH2O 并混合。
  3. 1X SDS 上样缓冲液：Blue Loading Pack (#7722) 或 Red Loading Pack (#7723) 通过添加 1/10 体积的 30X DTT 至 1 体积的 3X SDS 上样缓冲液，以制备新鲜的 3X 还原性上样缓冲液。用 dH2O 将其稀释至 1X。
  4. 10X Tris-Glycine SDS 电泳缓冲液：(#4050) 要制备 1 L 1X 电泳缓冲液：添加 100 ml 10X 电泳缓冲液至 900 ml dH2O 中并混合。
  5. 10X Tris-Glycine 转移缓冲液：(#12539) 要制备 1 L 1X 转移缓冲液：将 100 ml 10X 转移缓冲液添加至 200 ml 甲醇 + 700 ml dH2O 中，并混合。
  6. 含有 Tween® 20 (TBST) 的 10 X Tris 盐缓冲液：(#9997) 要制备 1 L 1X TBST： 将 100 ml 10X TBST 添加至 900 ml dH2O 中并混合。
  7. 脱脂奶粉：(#9999)。
  8. 封闭缓冲液：含 5% w/v 脱脂奶粉的 1X TBST；要制备 150 ml，将 7.5 g 脱脂奶粉添加至 150 ml 1X TBST 中并充分混匀。
  9. 洗涤缓冲液：(#9997) 1X TBST。
  10. 一抗稀释缓冲液：含 5% 脱脂奶粉的 1X TBST；要制备 20 ml，将 1.0 g 脱脂奶粉添加至 20 ml 1X TBST 中并充分混匀。
  11. Biotinylated Protein Ladder Detection Pack：(#7727)。
  12. Prestained Protein Marker, Broad Range (11-190 kDa)：(#13953)。
  13. 印迹膜：(#12369) 本实验步骤针对硝酸纤维素膜进行了优化。通常推荐 0.2 µm 孔径。
  14. HRP 偶联二抗：Anti-rabbit IgG、HRP-linked Antibody (#7074)。
  15. 检测试剂：SignalFire™ ECL Reagent (#6883)。

B. 蛋白质印迹

制备样品的常规流程。

  1. 添加含有调节因子的新鲜培养基，使其对细胞进行处理一段时间。
  2. 从培养物中吸出培养基；用 1X PBS 洗涤细胞；吸出。
  3. 加入 1X SDS 样品缓冲液（6 孔板每孔 100 µl 或 10 cm 直径的平板 500 µl）来裂解细胞。立即从板上刮下细胞并将提取物转移至微量离心管。置于冰上。
  4. 超声处理 10–15 秒以完成细胞裂解并剪切 DNA（以降低样品粘度）。
  5. 取 20 µl 样品，在 95–100°C 下加热 5 分钟；放在冰上冷却。
  6. 微量离心机内离心 5 分钟。

  7. 上样 20 µl 到 SDS-PAGE 凝胶 (10 cm x 10 cm) 上。

    注意：建议将预染蛋白分子量标准品（#13953，10 µl/泳道）上样，以验证转膜的效率，生物素化蛋白质标准品（#7727，10 µl/泳道）可以直接在膜上显出条带以确定分子量。

  8. 电转至硝酸纤维素膜 (#12369)。

C. 膜封闭和抗体孵育

注意：体积适用于 10 cm x 10 cm (100 cm2) 的膜；对于不同尺寸的膜，可相应调整体积。

I. 膜封闭

  1. （可选）转移之后，在室温下用 25 ml TBS 将硝酸纤维素膜洗涤 5 分钟。
  2. 将膜置于 25 ml 封闭缓冲液中，在室温下孵育 1 小时。
  3. 用 15ml TBST 洗涤三次，每次 5 分钟。

II. 一抗孵育

  1. 将膜和一抗（按照产品网页中建议的适当稀释度和稀释液）置于 10 ml 一抗稀释缓冲液中在 4°C 下孵育过夜并不时轻轻晃动。
  2. 用 15ml TBST 洗涤三次，每次 5 分钟。
  3. 将膜与 Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody （#7074，按 1:2000 的比例）和 Anti-biotin, HRP-linked Antibody （#7075，按 1:1000–1:3000 的比例）一起孵育，并且轻轻晃动且在室温下孵育 1 小时后，再检测 10 ml 封闭缓冲液中的生物素化蛋白标记物。
  4. 用 15ml TBST 洗涤三次，每次 5 分钟。
  5. 继续进行检测（D 部分）。

D. 蛋白质检测

使用说明：

  1. 在 TBST 中清洗与膜结合的 HRP (Antibody Conjugate) 三次，持续 5 分钟。
  2. 通过稀释一部分 2X 试剂 A 和一部分 2X 试剂 B（例如：要制备 10 ml，则添加 5 ml 试剂 A 和 5 ml 试剂 B），来制备 1X SignalFire™ ECL Reagent (#6883)。混匀。
  3. 将底物与膜一起孵育 1 分钟，倒掉多余溶液（膜将保持湿润），然后包裹在塑料中并在 X 线胶片下曝光。

* 避免反复接触皮肤。

发布​于 2005 年 6 月 

修订于 2020 年 6 月

实验步骤编号：263

天然蛋白质免疫沉淀法

本实验步骤适用于使用 Protein A agarose beads 对天然蛋白进行免疫沉淀，以进行蛋白质免疫印迹或激酶活性分析。

A. 溶液和试剂

注意：使用反渗透去离子水 (RODI) 或同等级别的水制备溶液。

  1. 20 X 磷酸盐缓冲液 (PBS)：(#9808) 要制备 1 L 1X PBS，将 50 ml 20X PBS 添加至 950 ml dH2O 中并混合。

  2. 10X 细胞裂解缓冲液：(#9803) 要制备 10 ml 的 1X 细胞裂解缓冲液，将 1 ml 细胞裂解缓冲液添加至 9 ml dH2O，并混合。

    注意：使用前，请立即添加 1 mM PMSF (#8553)。

  3. 3X SDS上样缓冲液：Blue Loading Pack (#7722) 或 Red Loading Pack (#7723) 通过添加 1/10 体积的 30X DTT 至 1 体积的 3X SDS 上样缓冲液，制备新鲜的 3X 还原性上样缓冲液。
  4. Protein A Agarose Beads：(#9863)。
  5. 10X 激酶缓冲液（用于激酶试验）：(#9802) 要制备 1 ml 的 1X 激酶缓冲液，将 100 µl 10X 激酶缓冲液添加至 900 µl dH2O 中并混合。
  6. ATP (10 mM)（用于激酶试验）：(#9804) 要制备 0.5 ml 的 ATP (200 µM)，将10 µl ATP (10 mM) 添加至 490 µl 1X 激酶缓冲液中。

B. 制备细胞裂解物

  1. 吸干培养基。添加含有调节因子的新鲜培养基，使其对细胞进行处理一段时间。
  2. 在非变性条件下收集细胞，去除培养基后用冰预冷的 1X PBS 洗涤细胞一次。
  3. 去除 PBS，每块平板 (10 cm) 添加 0.5 ml 冰冷的 1X 细胞裂解缓冲液，平板放在冰上孵育 5 分钟。
  4. 从板上刮下细胞，把提取物转移至微量离心管。置于冰上。
  5. 在冰上进行 3 次超声破碎，每次 5 秒。
  6. 在 4°C，在 14,000 x g 条件下，微量离心 10 分钟，将上清转移到新管中。上清液即为细胞裂解物。如有必要，裂解物可保存在 –80°C。

C. 免疫沉淀法

细胞裂解物预澄清（可选）

  1. 涡旋振荡，以混合磁珠。
  2. 添加 10–30 µl 的 50% Protein A agarose beads 混悬液至 200 µl 细胞裂解物中 (1 mg/ml)。
  3. 在 4°C 下，旋转孵育 30–60 分钟。
  4. 4°C 条件下微量离心 10 分钟。将上清转移到新管中。
  5. 继续以下的免疫沉淀法。

免疫沉淀

  1. 将一抗（按产品说明书中推荐的合适稀释比例配制）加入到浓度为 1 mg/ml 200 µl 细胞裂解物中。在 4°C 下，旋转孵育过夜。
  2. 添加 protein A 琼脂糖（10–30 µl 的 50% 珠浆）。在 4°C 下，旋转孵育 1-3 小时。
  3. 4°C 条件下微量离心 30 秒。用 500 µl 的 1X 细胞裂解缓冲液，洗涤沉淀物五次。洗涤间期，保持样品于冰上。
  4. 继续使用蛋白免疫印迹法或激酶活性检测对样品进行分析（D 部分）。

D. 样品分析

继续下述其中一项的具体步骤。

用蛋白免疫印迹法进行分析

  1. 用 20 µl 3X SDS 样品缓冲液重悬沉淀物。涡旋振荡，然后在 14,000 x g 下瞬时离心 30 秒。
  2. 将样品加热至 95–100°C 并持续 2-5 分钟，然后在 14,000 x g 下微量离心 1 分钟。
  3. 对于 SDS-PAGE，将样品 (15–30 µl) 上样至 4–20% 凝胶上。
  4. 用蛋白质印迹法分析样品（请参阅蛋白质免疫印迹法实验步骤）。

注意：为了最大限度减少变性 IgG 重链产生的遮盖作用 (~50 kDa)，我们建议使用 Mouse Anti-Rabbit IgG (Light-Chain Specific) (L57A3) mAb (#3677) 或 Mouse Anti-Rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb (#3678)（或 HRP conjugate #5127）。为了最大限度减少变性 IgG 轻链产生的遮盖作用 (~25 kDa)，我们建议使用 Mouse Anti-Rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb (#3678)（或 HRP conjugate #5127）

用激酶活性测定法进行分析

  1. 用 500 µl 1X 激酶缓冲液洗涤沉淀物两次。置于冰上。
  2. 在 40 µl 1X 激酶缓冲液中悬浮沉淀物，并补充 200 µM ATP 和适当的底物。
  3. 30°C 条件下孵育 30 分钟。
  4. 用 20 µl 3X SDS 样品缓冲液终止反应。涡旋振荡，然后再微量离心 30 秒。
  5. 将含有磷酸化底物的上清转移到另一管中。
  6. 将样品加热至 95–100°C 并持续 2-5 分钟，然后在 14,000 x g 下微量离心 1 分钟。
  7. 将样品上样 (15–30 µl) 到 SDS-PAGE (4–20%) 上。

发布​于 2008 年 12 月 

修订于 2018 年 4 月

实验步骤编号：409

特异性/敏感性

Phospho-BMAL1 (Ser42) Antibody 仅当 Ser42 磷酸化后可识别内源水平的 BMAL1 蛋白。该抗体可识别部分细胞中约40kDa 和100 kDa 的额外蛋白。

物种反应性：

人, 小鼠, 大鼠

来源/纯化

使用与人 BMAL1 蛋白的 Ser42 周围残基相对应的合成磷酸肽，对动物进行免疫接种来产生多克隆抗体。使用蛋白质 A 和肽亲和色谱对抗体进行纯化。

背景

昼夜节律控制了许多关键生理过程，这些过程随大约 24 小时内的某个时间段波动。这些生理过程包括醒睡周期、糖、脂肪和药物代谢、心率、激素分泌、肾血流体温、以及细胞的基本生理过程（如 DNA 修复、细胞分裂周期计时）(1,2)。哺乳动物的昼夜节律系统包含许多独立的组织特异性生物钟（外周生物钟），这些生物钟是由位于脑组织中视交叉上核 (SCN) 中的昼夜节律主要起搏点控制的 (1,2)。周期性昼夜节律主要通过明-暗周期体现，后者是通过视觉系统得以感知并由 SCN 进行处理。SCN 处理明-暗信息并通过神经和激素输出信号来同步外周生物钟 (1,2)。

细胞生物钟包含互相交织的正反调节环或调节分支 (1,2)。正性调节分支包括 CLOCK 和 BMAL1 蛋白，这是两个含有螺旋-环-螺旋-PAS 结构的基本转录因子，可结合 E 框增强子成分并激活其靶标基因的转录。CLOCK 是一个组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 蛋白，可乙酰化组蛋白 H3 和 H4 (3)。BMAL1 可结合到 CLOCK 并增强其 HAT 活性 (3)。CLOCK/BMAL1 二聚体在胞核/胞质定位和蛋白水平都表现出周期振荡，二者都可通过磷酸化进行调节 (4,5)。CLOCK/BMAL1 的靶标基因包括 Cry 和 Per 基因，二者的蛋白形成了生物钟系统的负调控分支 (1,2)。CRY 和 PER 蛋白 (CRY1、CRY2、PER1、PER2 和 PER3) 形成低聚物，该低聚物同样可在胞核与细胞浆之间周期性往返。在胞核中，CRY/PER 蛋白可抑制 CLOCK/BMAL1 介导的转录激活，因此完成生理转录环 (1,2)。在组织中，大约百分之六到八的基因显示出昼夜节律的表达模式 (1,2)。基因表达的这种 24 小时周期性是源于细胞生物钟系统的正和负调节分支协同作用，并且由 SCN 接收到的外界信号进行微调。

  1. Albrecht, U. and Eichele, G. (2003) Curr Opin Genet Dev 13, 271-7.
  2. Virshup, D.M. et al. (2007) Cold Spring Harb Symp Quant Biol 72, 413-20.
  3. Doi, M. et al. (2006) Cell 125, 497-508.
  4. Kondratov, R.V. et al. (2003) Genes Dev 17, 1921-32.
  5. Kwon, I. et al. (2006) Mol Cell Biol 26, 7318-30.

通路和蛋白

探索与本品相关的通路 + 蛋白。

限制使用

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