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CUT&RUN:分析表观遗传标记和机制的新方法

 

C leavage U nder T argets & R elease U sing N uclease (CUT&RUN) 是一种新技术,可用于探索蛋白质-DNA 相互作用。用于标测蛋白质-DNA相互作用的当前技术具有某些局限性。Cell Signaling Technology® (CST) 提供的 CUT&RUN 测定法可克服其他全基因组比对技术面临的许多挑战。要了解更多信息,请访问“CUT&RUN”网页

观看本网络研讨会记录以了解:

  • 了解 CUT&RUN 和 ChIP 之间的区别
  • 了解 CUT&RUN 如何与低细胞数相容,并减少分析蛋白质-DNA 相互作用时的背景
  • 聆听法国 LBMC 的 Paul Marie 如何将 CUT&RUN 融入有关 NF-kB 通路激活的研究

特邀演讲人

Francesco Pinto,博士

现场应用科学家

Cell Signaling Technology

与染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测一样,核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN) 是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA 相互作用的强大通用技术 (1-)。可以将CUT&RUN测定与下游qPCR或NG-seq结合,以分析特定靶标基因或整个基因组处的组蛋白修饰和转录因子、DNA复制因子或DNA修复蛋白的结合。CUT&RUN 提供了一种检测细胞中蛋白-DNA 相互作用的快速、可靠且真正的低细胞数测定法。今天,我将讨论如何在短短一到两天内使用100,000细胞进行每次检测。

特邀演讲人

Paul Marie

博士生

LBMC ENS-莱昂

Paul Marie 是 ENS-Lyon 生物学和细胞建模实验室 (LBMC) 基因组架构和剪接动力学 (ReGArDS) 小组的监管博士学位。他的工作集中在 NF-κB 通路的激活(特别是通过 HTLV-1 的病毒致癌基因 Tax)及其对基因组结构、转录调控和选择性剪切的影响。在最近的出版物中,他确定了 NF-kB 在替代剪接调控中的新功能,该功能依赖于 NF-kB 因子 RelA 对剪切调节剂 DDX17 的基因内募集。他现在的目标是评估这种机制对组蛋白调控和染色质结构的功能影响。凭借使用染色体构象捕获测定法,他的初步结果表明 Tax 影响了基因组结构。他目前的目标是以全基因组的方式进一步表征 RelA 基因内募集对 Tax 建立的表观遗传模式的影响。为此,他使用 Cell Signaling Technology 的 CUT&RUN 检测试剂盒开发了针对转录因子 RelA 和几个组蛋白标记的 qChIP 和 CUT&RUN 方法。

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