对促销感兴趣? | 点击此处 >>

遗传图谱绘制程序

人类激酶组 进化树图的主干(右上)显示蛋白激酶结构域间的序列相似性,这来自于公共序列和 Manning 等人详述的基因预测方法(Science, 298, 1912-1934)。通过隐马尔可夫模型剖面分析和多序列比对,可确定结构域。通过对 clustalW 蛋白结构域的多序列比对,得出邻接树,并由此构建初始分支模式。通过参考其他比对和树构建方法(隐马尔可夫模型比对和最大简约法),以及对激酶结构域的大量两两序列比对后,对初始分支模式进行了广泛修改。人工绘制曲线布图。许多分支长度是半定量,但分支模式与任何单一自动方法相比,信息量更大。后面几页中更详细的树图是通过对全长蛋白序列进行 clustalW 比对,继以构建邻接树,而自动生成的。未发表的激酶可根据家族命名法进行命名。某些不同的激酶保留了一个数字化 SgK(SuGen 激酶)编号。双结构域激酶的第二结构域使用 “~b” 的后缀命名。
Powered by Translations.com GlobalLink OneLink SoftwarePowered By OneLink