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人类蛋白激酶概述

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组别名称

激酶 描述
AGC 含有 PKA、PKG、PKC 家族
CAMK 依赖于钙离子/钙调素的蛋白激酶
CK1 Casein kinase 1
CMGC 含有 CDK、MAPK、GSK3、CLK 家族
STE 酵母 Sterile7、Sterile 11、Sterile 20 激酶的同源物
TK 酪氨酸激酶
TKL 酪氨酸激酶样

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人激酶组。CAMK 组。 AGC 组。 CK1 组。 STE 组。 TKL 组。 CMGC 组。 TK 组。

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主要树状图显示了蛋白激酶结构域之间的序列相似性,这些蛋白激酶结构域来自于公开序列和 Manning 等人详述的基因预测方法。(Science, 298, 1912-1934)。通过隐马尔可夫模型剖面分析和多序列比对,可确定结构域。通过对 clustalW 蛋白结构域的多序列比对,得出邻接树,并由此构建初始分支模式。通过参考其他比对和树构建方法(隐马尔可夫模型比对和最大简约法),以及对激酶结构域的大量两两序列比对后,对初始分支模式进行了广泛修改。人工绘制曲线布图。许多分支长度是半定量,但分支模式与任何单一自动方法相比,信息量更大。更详细的树图是通过对全长蛋白序列进行 clustalW 比对,继以构建邻接树而自动生成的。未发表的激酶可根据家族命名法进行命名。某些不同的激酶保留了一个数字化 SgK(SuGen 激酶)编号。双结构域激酶的第二结构域使用 “~b” 的后缀命名。

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