反应性 | All |
灵敏度 | 内源性 |
MW (kDa) | |
来源/同种型 | 兔 IgG |
产品信息
一个独立实验室的实验表明,该抗体在 RNA-IP-seq 中有效。请按实验决定的稀释度使用。
注:编写本实验步骤是为了使用 96 孔点印迹仪,将纯化的总 RNA 或 poly A 纯化的 mRNA(滴定度为 2 ng、1 μg、500 ng、250 ng、125 ng、62.5 ng 和 31.25 ng)点样到带正电荷的尼龙膜上。根据 RNA 的来源,用抗体检测可能需要更多或更少的 RNA。
启动前:
• RNA 对 RNase 降解敏感,RNA 降解会影响样品的完整性。建议所有表面和设备都经过 RNase 净化处理。• 使用 RNA 分离试剂盒从细胞沉淀物中纯化总 RNA 和/或 mRNA。通过在 1% 琼脂糖凝胶上进行凝胶电泳来评估总 RNA 的质量。28S 和 18S RNA 应该呈现为不同的条带。涂片表明 RNA 降解。参见图 1。• 将一片尼龙膜切割成点印迹多管吸印仪的尺寸。
• 用 10X SSC 缓冲液润湿尼龙膜。• 通过在 96 孔点印迹仪中放置尼龙膜并施加真空,使其干燥。
可选:要使用亚甲基蓝标准化样品加载,请在 C 节第 1 步之前涂上染色剂并拍摄图像。用 15 mL dH 2 O 漂洗三次,每次 5 分钟。染色不影响抗体结合或检测。
注:由于检测反应的动力学,信号在孵育后最强并且在后续 2 小时内减弱。
图 1. 分离的、完整的总 RNA 的代表性图像。28S 和 18S RNA 应迁移为不同的条带。如果 RNA 表现为涂片,则样品可能会降解,不适合用于下游测定。泳道 1 是 NEB 100 bp DNA 阶梯,泳道 2 是从 293T 细胞分离的总 RNA。
发布时间 2018 年 11 月
实验步骤编号:1784
预期的所有物种
使用 N6-甲基腺苷对动物进行免疫接种来产生单克隆抗体。
N6-甲基腺苷 (m6A) 是一种在多个 RNA 亚型中发现的转录后修饰。虽然几十年前就发现了 RNA 中存在 m6A,但工具的缺乏使得表观转录组环境研究变得具有挑战性 (1,2)。随着 miCLIP 和 NG-RNA-seq 等新技术的出现,研究人员已经能够发现 m6A 是 mRNA 中的一种生物相关标记,并在 3’ UTR 和终止密码子中富集 (3,4)。m6A 写入蛋白复合体包含甲基转移酶样蛋白 3 (METTL3) 和甲基转移酶样蛋白 14 (METTL14) 的核心异二聚体,以及 Virlizer/VIRMA 和肾母细胞瘤 (Wilms tumor) 1 相关蛋白 (WTAP) 等其他调节蛋白 (5)。METTL3 是催化甲基转移酶亚基,而 METTL14 则是结合 RNA 的靶标识别亚基 (6)。Virilzer/VIRMA 蛋白将 m6A 甲基化导向至 3’ UTR 和终止密码子,WTAP 将复合体靶向胞核小点(RNA 加工位点)(7)。有关 m6A 读取蛋白和擦除蛋白的信息知之甚少,虽然脂肪量和肥胖相关蛋白 FTO 是最先发现的 m6A 去甲基化酶,但随后的研究证明这种酶在体内可能更倾向于密切相关的 m6Am 标记 (8,9)。后来证明,ALKBH5 是一种真正的 m6A 去甲基化酶,因此得出 m6A 修饰是动态调控的结论 (10)。m6A 标记的读取蛋白包括 YTH 蛋白家族,这个家族结合 m6A 并影响 mRNA 稳定性和翻译效率 (3,11-13)。m6A 标记和分子组经证实可调节各种细胞功能,包括 RNA 剪切、翻译调控、多能性和细胞命运决定、神经元功能及疾病 (1, 14-17)。m6A 写入蛋白复合体与 AML 和子宫内膜癌等各种癌症类型有关 (18,19)。此外,m6A 与化疗耐药性有关20)。
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