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SH3 蛋白结构域

脯氨酸富集序列结合:SH3 结构域

结合 mSOS 肽(红色)的 SEM-5 的羧基末端 SH3 结构域。

结构域结合和功能

Src-同源 3 (SH3) 结构域结合脯氨酸富集肽,这种肽会与最小的共有 Pro-X-X-Pro 形成左侧聚脯氨酸 II 型螺旋。脂肪族残基通常在每个脯氨酸的前面,每个脂肪族脯氨酸对则与 SH3 结构域上的疏水口袋相结合。原则上,配体能以任意一种方向结合。其它非脯氨酸残基(经常是 Arg)结合 SH3 结构域,并形成结合核心的一部分。这类肽通常结合 SH3 结构域,µM 范围为 KdSH3 结构域上涉及环的三次相互作用会使结合亲和力和特异性明显增强。

结构参考

  1. Lim, W.A. et al. (1994) Nature 372(6504), 375–379.

结构域蛋白示例

脯氨酸富集序列结合:SH3 结构域

结合示例

SH3 结构域蛋白 结合伴侣 SH3 结构域结合位点
Src 酪氨酸激酶 Pl3 激酶的 p85 亚基 RPLPVAP I 类氨基末端-羧基末端结合位点
Crk 接头蛋白 C3G 胍核苷酸交换蛋白 PPPALPPKKR II 类羧基末端-氨基末端结合位点
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