Revision 2

#58214Store at -20C

1 个试剂盒

(7 x 20 microliters)

Cell Signaling Technology

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Web: [email protected] cellsignal.com

3 Trask LaneDanversMassachusetts01923USA
For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.
Product Includes Product # Quantity Mol. Wt Isotype/Source
ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 12354 20 µl 270 kDa Rabbit IgG
ARID1B/BAF250B (E9J4T) Rabbit mAb 92964 20 µl 250, 280 kDa Rabbit IgG
Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 49360 20 µl 220 kDa Rabbit IgG
BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb 11966 20 µl 200 kDa Rabbit IgG
SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 11956 20 µl 155 kDa Rabbit IgG
SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 12760 20 µl 162, 170 kDa Rabbit IgG
SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb 33360 20 µl 57 kDa Rabbit IgG
Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody 7074 100 µl Goat 

Please visit cellsignal.com for individual component applications, species cross-reactivity, dilutions, protocols, and additional product information.

Description

The BAF Complex Antibody Sampler Kit II provides an economical means of detecting levels of various BAF complex components. The kit contains enough primary antibodies to perform at least two western blot experiments.

Storage

Supplied in 10 mM sodium HEPES (pH 7.5), 150 mM NaCl, 100 µg/ml BSA, 50% glycerol and less than 0.02% sodium azide. Store at –20°C. Do not aliquot the antibody.

Background

ATP-dependent chromatin remodeling complexes play an essential role in the regulation of various nuclear processes, such as gene expression, DNA replication, and repair (1,2). The SWI/SNF chromatin remodeling complex consists of more than 10 subunits with a single molecule of the ATPase catalytic subunit BRM or BRG1, but not both. The activities of these two subunits drive the disruption of histone-DNA contacts that lead to changes in accessibility of crucial regulatory elements within chromatin (2-5). The BRM/BRG1 containing SWI/SNF complexes are recruited to target promoters by transcription factors, such as nuclear receptors, p53, RB, and BRCA1 to regulate gene activation, cell growth, the cell cycle, and differentiation processes (1,6-9). BRM and BRG1 are also considered to be tumor suppressors and their expression levels are severely reduced in several cancer cell lines (10-13). SMARCC1/BAF155, SMARCC2/BAF170, and SMARCB1/BAF47 are members of the core subunits of the SWI/SNF complex, which is necessary for efficient nucleosome remodeling by BRG1 in vitro (14). ARID1A/BAF250A and ARID1B/BAF250B are DNA-binding members of the complex. They are highly homologous and mutually exclusive, with ARID1B/BAF250B being a critical vulnerability in ARID1A/BAF250A mutant cancers (15-17). SMARCC1, SMARCB1, and ARID1A are an essential part of the mouse embryonic stem cell specific SWI/SNF complex (esBAF). SMARCC1 is necessary for early embryogenesis, especially proper brain and visceral endoderm development (18-20). SMARCB1 is necessary for early embryogenesis and hepatocyte differentiation (21,22). ARID1A is critical for embryonic stem (ES) cell pluripotency and differentiation into mesoderm-derived cardiomyocytes and adipocytes (15). While SMARCC2 has been shown to be part of the SWI/SNF complex in non-pluripotent cells, it is absent in pluripotent ES cells. Expression of SMARCC2 has been shown to be up-regulated in neurons/neuronal progenitors upon differentiation of mouse ES cells with retinoic acid, and exogenous expression of SMARCC2 leads to loss of stem cell pluripotency and self renewal (23).

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Background References

    Trademarks and Patents

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    Revision 2
    #58214

    BAF Complex Antibody Sampler Kit II

    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 1 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb #11966 对 A549 细胞的裂解物 (1 mg/mL) 进行 Simple Western™ 分析。虚拟泳道式图像(左图)显示一抗稀释比例为 1:10 和 1:50 时的靶标条带(如图所示)。对应的电泳图(右图)为一抗稀释比例在 1:10(蓝线)和 1:50(绿线)时沿毛细血管内分子量的化学发光结果。在还原条件下,使用 12-230 kDa 分离模块在 ProteinSimple(BioTechne 品牌)的 Jess™ Simple Western 仪器上进行该实验。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 2 Expand Image
    使用 ARID1B/BAF250B (E9J4T) Rabbit mAb #92964 对 Jurkat 细胞的裂解物 (0.1 mg/mL) 进行 Simple Western™ 分析。虚拟泳道式图像(左图)显示一抗稀释比例在 1:10 和 1:50 时的靶标条带(如图所示)。对应的电泳图(右图)为一抗稀释比例在 1:10(蓝线)和 1:50(绿线)时沿毛细血管内分子量的化学发光结果。在还原条件下,使用 66-440 kDa 分离模块在 ProteinSimple(BioTechne 品牌)的 Jess™ Simple Western 仪器上进行该实验。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 3 Expand Image
    使用 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 对不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 4 Expand Image
    CUT&Tag was performed with NCCIT cells and SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb, using CUT&Tag Assay Kit #77552. DNA library was prepared using CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems #47415. The figure shows binding across SOX2.
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 5 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb(上图)或 β-Actin (D6A8) Rabbit mAb #8457(下图)对对照的 HeLa 细胞(泳道 1)或 BRM 编码基因出现靶向突变的 HeLa 细胞(泳道 2)的提取物进行蛋白质印迹分析。突变型 HeLa 细胞的 BRM 分子量变化证实了抗体对 BRM 的特异性。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 6 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP (R) 兔单抗对石蜡包埋的人前列腺进行免疫组织化学分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 7 Expand Image
    使用 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 对不同细胞系提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 8 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对 NCCIT 细胞的交联染色质和 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。图片中显示 Oct-4/POU5F1 内结合,而 Oct-4/POU5F1 是已知的 ARID1A 靶标基因(请参阅含有 ChIP-qPCR 数据的附图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 9 Expand Image
    使用 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 对不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 10 Expand Image
    对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离 FBS 中生长 4 天后接着使用 β 雌二醇(10 nM,45 分钟)进行处理的 MCF7 细胞和 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 或 SMARCB1/BAF47 (D8M1X) Rabbit mAb #91735,通过 CUT&RUN Assay Kit #86652 进行 CUT&RUN 分析。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。该图显示了 SMARCC2/BAF170 的已知靶标基因 TMEM53 的结合(参见包含 CUT&RUN-qPCR 数据的其他结果图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 11 Expand Image
    使用 SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb(上图)和 β-Actin (D6A8) Rabbit mAb #8457(下图)对不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。BT-549 是一种缺乏 SMARCE1/BAF57 表达的乳腺导管癌细胞系。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 12 Expand Image
    CUT&RUN was performed with MCF7 cells grown in phenol red-free medium and 5% charcoal-stripped FBS for 4 d followed by treatment with β-estradiol (10 nM, 45 min) and SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb, using CUT&RUN Assay Kit #86652. 使用 DNA Library Prep Kit for Illumina Systems (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。The figure shows binding across MYB gene, a known target gene of SMARCE1 (see additional figure containing CUT&RUN-qPCR data).
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 13 Expand Image
    使用 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 对来自不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 14 Expand Image
    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652 对 NCCIT 细胞和 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 进行 CUT&RUN 分析。‚使用 DNA Library Prep Kit for Illumina®(ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。该图显示在 TNN 基因内结合。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 15 Expand Image
    一抗与靶标蛋白结合之后,与偶联 HRP 的二抗形成复合体。添加 LumiGLO®,在酶催化分解期间发光。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 16 Expand Image
    使用 ARID1B/BAF250B (E9J4T) Rabbit mAb(上图)和 α-Actinin (D6F6) Rabbit mAb #6487(下图)对不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。MIA PaCa-2 细胞不表达 ARID1B/BAF250B 蛋白。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 17 Expand Image
    使用 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900(泳道 2)或 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb (泳道 3),对 HeLa 细胞提取物 SMARCC1/BAF155 进行免疫沉淀。泳道 1 是 10% 输入对照。使用 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 18 Expand Image
    CUT&Tag was performed with NCCIT cells and SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb, using CUT&Tag Assay Kit #77552. DNA library was prepared using CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems #47415. The figures show binding across chromosome 3 (upper), including SOX2 gene (lower).
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 19 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP (R) 兔单抗对石蜡包埋的人结肠癌进行免疫组织化学分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 20 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP® 兔单抗(上)或 Brg1 (A52) Antibody #3508(下)对来自不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 21 Expand Image
    使用 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb(上)或 ß-Actin (D6A8) Rabbit mAb #8457(下)对 T-47D 和 Jurkat 细胞提取物进行蛋白质印迹分析。135kDa-250kDa 之间的某些细胞提取物中可能检测到其他 ARID1A/BAF250A 降解产物,而在 ARID1A/BAF250A 阴性 T-47D 细胞系中缺失这些降解产物。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 22 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对 NCCIT 细胞的交联染色质和 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。该图显示在染色体 6(上图)内的结合,包括 ARID1A 的已知靶标基因 Oct-4/POU5F1(下图)(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 23 Expand Image
    使用 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900(泳道 2)或 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb (泳道 3),对 PANC-1 细胞提取物 SMARCC2/BAF170 进行免疫沉淀。泳道 1 是 10% 输入对照。使用 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 24 Expand Image
    对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离 FBS 中生长 4 天后接着使用 β 雌二醇(10 nM,45 分钟)进行处理的 MCF7 细胞和 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 或 SMARCB1/BAF47 (D8M1X) Rabbit mAb #91735,通过 CUT&RUN Assay Kit #86652 进行 CUT&RUN 分析。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。这些图显示了在染色体 1 内的结合(上图),包括 SMARCC2/BAF170 的已知靶标基因 TMEM53(下图)(参见包含 CUT&RUN-qPCR 数据的其他结果图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 25 Expand Image
    对 MCF7 细胞提取物的 SMARCE1/BAF57 进行免疫沉淀。泳道 1 为 10% input,泳道 2 为 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900,泳道 3 为 SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb。使用 SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb 进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 26 Expand Image
    CUT&RUN was performed with MCF7 cells grown in phenol red-free medium and 5% charcoal-stripped FBS for 4 d followed by treatment with β-estradiol (10 nM, 45 min) and SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb, using CUT&RUN Assay Kit #86652. 使用 DNA Library Prep Kit for Illumina Systems (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。The figures show binding across chromosome 6 (upper), including MYB (lower), a known target gene of SMARCE1 (see additional figure containing CUT&RUN-qPCR data).
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 27 Expand Image
    使用 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb(上)或 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb(下)对来自不同细胞系的提取物进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 28 Expand Image
    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652 对 NCCIT 细胞和 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 进行 CUT&RUN 分析。‚使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。该图显示在染色体 1(上图)内的结合,包括 TNN 基因(下图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 29 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb, SMARCB1/BAF47 (D8M1X) Rabbit mAb #91735 或 SS18 (D6I4Z) Rabbit mAb #21792 后进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。SMARCC1/BAF155、SMARCB1/BAF47 和 SS18 均为 SWI/SNF 复合体的所有亚基。结果图显示了 pS2/TFF1 内结合,pS2/TFF1 是一种已知的 SWI/SNF 靶标基因(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 30 Expand Image
    使用 BRM (D9E8B) XP (R) Rabbit mAb 对石蜡包埋的人卵巢透明细胞腺癌进行免疫组织化学分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 31 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对 NCCIT 细胞中提取的交联染色质,在加入 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729 后进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human Oct-4 Promoter Primers #4641、SimpleChIP® Human Sox2 Promoter Primers #4649 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486,通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 32 Expand Image
    使用 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 对小鼠结肠进行免疫组织化学分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 33 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 后进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。结果图显示在 ESR1 内结合,ESR1 是一种已知的 SMARCC2/BAF170 靶标基因(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 34 Expand Image
    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652,对在无酚红色培养基和 5% 活性炭炭剥离的 FBS 生长 4 天 ,接着用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)和 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 或 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control (CUT&RUN) #66362 处理的 MCF7 细胞进行 CUT&RUN 分析。使用 SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702、human TMEM53 promoter SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486,通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量分析。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 35 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,随后用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞的交联染色质与 SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729 进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702、SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 进行实时 PCR 来对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 36 Expand Image
    CUT&RUN was performed with MCF7 cells grown in phenol red-free medium and 5% charcoal-stripped FBS for 4 d followed by treatment with β-estradiol (10 nM, 45 min) and either SMARCE1/BAF57 (E6H5J) Rabbit mAb or Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control (CUT&RUN) #66362, using CUT&RUN Assay Kit #86652. The enriched DNA was quantified by real-time PCR using human MYB promoter primers, human ARL3 promoter primers, and human MRLN promoter primers. 将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 37 Expand Image
    对来自 NCCIT 细胞提取物的 Brg1 进行免疫沉淀。泳道 1 是 10% input,泳道 2 是 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900,而泳道 3 是 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb。使用 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 进行蛋白质印迹分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 38 Expand Image
    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652 对 NCCIT 细胞和 Brg1 (D1Q7F) Rabbit mAb 或 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control (CUT&RUN) #66362 进行 CUT&RUN。使用 SimpleChIP® Human HoxA1 Intron 1 Primers #7707、SimpleChIP® Human HoxA2 Promoter Primers #5517 和 human ITM2A upstream primers 进行实时 PCR 来对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 39 Expand Image
    使用 SimpleChIP® 酶解染色质免疫沉淀试剂盒(磁珠法) #9005 对在无酚红/炭剥离的 FBS 中生长 4 天,随后用 β-雌二醇 (10 nM) 处理 45 分钟的 MCF7 细胞的交联染色质与 ARID1B/BAF250B (E9J4T) 兔单克隆抗体进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® ChIP-seq DNA Library Prep Kit for Illumina® #56795 制备 DNA 文库。结果图显示在 ARID1B 的已知靶基因 TFF1/pS2 内结合(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。如需了解其他 ChIP-seq 情况,请下载产品说明书。
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    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb, SMARCB1/BAF47 (D8M1X) Rabbit mAb #91735 或 SS18 (D6I4Z) Rabbit mAb #21792 后进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。SMARCC1/BAF155、SMARCB1/BAF47 和 SS18 均为 SWI/SNF 复合体的所有亚基。结果图显示在染色体21(上图)内的结合,包括 SWI/SNF 复合体的已知靶标基因 pS2/TFF1(下图)(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
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    使用 BRM (D9E8B) XP (R) 兔单抗对石蜡包埋的 HeLa(左)细胞沉淀物和 NCC(右)细胞沉淀物进行免疫组织化学分析。
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    使用 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 对石蜡包埋的细胞沉淀物、COS-7(左)或 T-47D(右)进行免疫组织化学分析。
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    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 后进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。结果图显示在染色体6(上图)内的结合,包括 SMARCC2/BAF170 的已知靶标基因 ESR1(下图)(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
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    使用 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003,对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中培养 4 天,然后用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 Brg1 (D1Q7F) XP® Rabbit mAb 后,进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina®(ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。本图显示整个 ENSA 基因范围的结合作用。
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    使用 SimpleChIP® 酶解染色质免疫沉淀试剂盒(磁珠法) #9005 对在无酚红/炭剥离的 FBS 中生长 4 天,随后用 β-雌二醇 (10 nM) 处理 45 分钟的 MCF7 细胞的交联染色质与 ARID1B/BAF250B (E9J4T) 兔单克隆抗体进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® ChIP-seq DNA Library Prep Kit for Illumina® #56795 制备 DNA 文库。结果图显示在染色体 21(上图)内的结合,包括 ARID1B 的已知靶基因 TFF1/pS2 (下图)(参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)。
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    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729 后,进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673、SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 并通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
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    在对照肽(左)或抗原特异性肽(右)存在的情况下,使用 ARID1A/BAF250A (D2A8U) Rabbit mAb 对石蜡包埋的人肺腺鳞癌进行免疫组织化学分析。
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    使用 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 SMARCC2/BAF170 (D8O9V) Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729 后进行染色质免疫沉淀分析。使用 SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673、SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 并通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
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    使用 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003,对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中培养 4 天,然后用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 Brg1 (D1Q7F) XP® Rabbit mAb 后,进行染色质免疫沉淀。使用 DNA Library Prep Kit for Illumina®(ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。结果图显示在 ESR1(上图)内的结合,包括 Brg1 的已知靶基因 (参见包含 ChIP-qPCR 数据的其他结果图)和 ENSA 基因。
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    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (磁珠法) #9005 对在无酚红/活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,随后用 β-雌二醇 (10 nM) 处理 45 分钟的 MCF7 细胞的交联染色质与 ARID1B/BAF250B (E9J4T) 兔单克隆抗体 或 正常兔 IgG #2729c 进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702、SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 进行实时 PCR 来对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
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    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652,通过 NCCIT 细胞和 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 进行 CUT&RUN。‚使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。图形显示在 Sox2 内结合,Sox2 是一种已知的 SMARCC1 靶标基因(参见包含 CUT&RUN-qPCR 数据的其他图形)。
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    使用 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003,对在无酚红培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中培养 4 天,随后用 β-雌二醇(10 nM,45 分钟)处理的 MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入 Brg1 (D1Q7F) XP® Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729 后,进行染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673、SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 并通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
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    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652,通过 NCCIT 细胞和 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 进行 CUT&RUN。‚使用 DNA Library Prep Kit for Illumina® (ChIP-seq, CUT&RUN) #56795 制备 DNA 库。结果图显示在染色体 3(上图)内的结合,包括 SMARCC1 的已知靶标基因 Sox2(下图)(参见包含 CUT&RUN-qPCR 数据的其他结果图)。
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    使用 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb(绿色)和 β-Actin (8H10D10) Mouse mAb #3700(红色)对 HeLa(阳性,左)细胞和 NCC(阴性,右)细胞进行共聚焦免疫荧光分析。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 55 Expand Image
    使用 CUT&RUN Assay Kit #86652,NCCIT 细胞和 SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb 或 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control (CUT&RUN) #66362进行 CUT&RUN。使用 SimpleChIP® Human Oct-4 Promoter Primers #4641、SimpleChIP® Human Sox2 Promoter Primers #4649 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486,通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 56 Expand Image
    使用 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003,对在无酚红的培养基和 5% 活性炭剥离的 FBS 中生长 4 天,然后使用 β-雌二醇(10 nM, 45 分钟)处理的MCF7 细胞中提取的交联染色质,在加入BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb 或 Normal Rabbit IgG #2729后,进行交联染色质免疫沉淀。使用 SimpleChIP® Human ESR1 Promoter Primers #9673、SimpleChIP® Human pS2 Promoter Primers #9702 和 SimpleChIP® Human α Satellite Repeat Primers #4486 并通过实时 PCR 对富集的 DNA 进行定量。将每份样品中免疫沉淀的 DNA 的量表现为相对于所输入染色质总量(等于 1)的信号。
    BAF Complex Antibody Sampler Kit II: Image 57 Expand Image
    对 HeLa 细胞提取物的 BRM 蛋白进行的免疫沉淀分析。泳道 1 为 10 % 输入,泳道 2 为 Rabbit (DA1E) mAb IgG XP® Isotype Control #3900,泳道 3 为 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb。使用 BRM (D9E8B) XP® Rabbit mAb 进行蛋白质印迹分析。